MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

Intel MKL库提供了大量优化程度高、效率快的稀疏矩阵算法,使用MKL库的将大型矩阵进行稀疏表示后,利用稀疏矩阵运算可大量节省计算时间和空间,但由于MKL中的原生API接口繁杂,因此将常用函数封装,便于后续使用,最后在实际例子中调用接口执行想要的矩阵运算。

0 稀疏矩阵

稀疏矩阵是指矩阵中大部分元素为0的矩阵。存储这些0值数据会耗费大量的存储空间,并且计算时也会产生不必要的时间浪费。为了更有效地存储和处理这种类型的矩阵,有几种不同的稀疏矩阵格式。

下面是几种常见的稀疏矩阵格式:

  • COO格式:COO格式(坐标格式)用三个数组存储非零元素的行、列索引以及值。
  • CSR格式:CSR格式(压缩行格式)用三个数组存储矩阵的非零元素值、列索引和行指针。行指针数组指示每行中第一个非零元素的位置。
  • CSC格式:CSC格式(压缩列格式)与CSR格式类似,但是是按列存储非零元素。
  • DIA格式:DIA格式(对角线格式)使用一个二维数组存储非零元素。数组中的每一行表示矩阵的一个对角线,并且只有矩阵中存在的对角线上的元素才被存储。
  • BSR格式:BSR格式(块压缩行格式)用四个数组存储矩阵的非零元素。其中三个数组与CSR格式相同,第四个数组存储块的大小。
  • ELL格式:ELL格式(行程格式)使用两个数组存储矩阵的非零元素。其中一个数组存储元素的值,另一个数组存储元素在每行中的位置。每行中最大非零元素数量相同。

MKL中主要用到的稀疏矩阵格式有COOCSRCSC(与CSR类似)三种,以下将简要介绍COO格式与CSR格式:

(1)COO(Coordinate,坐标格式)

也被称为三元组格式,在 COO 格式中,每一个非零元素都用一个三元组 (row, column, value) 来表示,其中 row 和 column 分别代表该元素所在的行和列的索引,value 则代表该元素的值。由于 COO 格式中的非零元素的存储是无序的,因此在进行矩阵向量乘法等操作时,需要对 COO 格式进行排序。

COO 格式的优点:非常简单直观,易于理解和实现,同时可以处理任意稀疏度的矩阵。

缺点:存储开销较大,需要存储每个非零元素的行列索引,同时由于无序存储的缘故,在进行一些稀疏矩阵的计算时会需要排序,因此在效率上可能不如其他稀疏矩阵格式。

例:

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

(2)CSR(Compressed Sparse Row,行压缩格式)

常用于稀疏矩阵的存储和计算,CSR格式通过将矩阵的非零元素存储在一个一维数组中,并用两个一维数组存储行指针和列指针,来有效地压缩稀疏矩阵的存储空间。

CSR格式的一维数组包含三个部分:数据、列索引和行指针。假设稀疏矩阵的大小为m × n,其中非零元素个数为nnz。分别介绍这三个数组的含义:

  • 数据数组(values array):存储非零元素的值,大小为nnz。
  • 列索引数组(column indices array):存储每个非零元素所在的列数,大小为nnz。
  • 行指针数组(row pointer array):存储每一行的第一个非零元素在数据数组中的下标,大小为m+1。

例:

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

1 稀疏矩阵乘法

所用示例如下,矩阵A、B分别为

\[A = {\left[ {\begin{array}{*{20}{c}} {\begin{array}{*{20}{c}} 1&{ - 1} \end{array}}&{ - 3}&0&0\\ {\begin{array}{*{20}{c}} { - 2}&5 \end{array}}&0&0&0\\ {\begin{array}{*{20}{c}} 0&0 \end{array}}&4&6&4\\ {\begin{array}{*{20}{c}} {\begin{array}{*{20}{l}} { - 4}\\ 0\\ 1 \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{l}} 0\\ 8\\ 0 \end{array}} \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{l}} 2\\ 0\\ 0 \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{l}} 7\\ 0\\ 0 \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{l}} 0\\ { - 5}\\ 0 \end{array}} \end{array}} \right]_{6 \times 5}}{\begin{array}{*{20}{c}} {}&{B = \left[ {\begin{array}{*{20}{c}} {\begin{array}{*{20}{c}} 1\\ { - 2} \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{c}} { - 1}\\ 5 \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{c}} { - 3}\\ 0 \end{array}}&{\begin{array}{*{20}{c}} 0\\ 0 \end{array}}\\ 0&0&4&6\\ { - 4}&0&2&7\\ 0&8&0&0 \end{array}} \right]} \end{array}_{5 \times 4}} \]

(1)matlab计算结果

作为标准答案,验证后续调用的正确性。

A=[1,-1,-3,0,0;
  -2,5,0,0,0;
   0,0,4,6,4;
  -4,0,2,7,0;
   0,8,0,0,-5;
   1,0,0,0,0];

B=[1,-1,-3,0;
  -2,5,0,0;
   0,0,4,6;
  -4,0,2,7;
   0,8,0,0];

A*B

输出为:

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

(2)稀疏矩阵X稠密矩阵

用于计算稀疏矩阵(COO格式表示)的矩阵\(A\),与稠密矩阵\(B\)的乘积。

函数将使用MKL库中的稀疏矩阵乘法接口mkl_sparse_s_mm实现\(y = alpha * A * x + beta * y\),具体用法及参数详解如下:

mkl_sparse_s_mm(operation, //表示矩阵乘法的操作类型,可以是普通/转置/共轭转置
                alpha,	//乘法系数
                A, 	//稀疏矩阵A
                descr, //结构体,描述矩阵的属性,包括存储格式、存储顺序等
                SPARSE_LAYOUT_ROW_MAJOR,//矩阵存储顺序
                x,	//X矩阵,稠密
                columns, // 矩阵x的列数
                ldx, 	//矩阵x的第一维
                beta,	//加法后系数
                y,	//y矩阵,即输出矩阵
                ldy	//矩阵y的第一维
               );

此流程简述如下:

  1. 获取待稀疏表示矩阵\(A\)的COO格式(ia,ja,value),以及非零元素个数nnz;
  2. 根据三组数据创建COO格式稀疏矩阵,并通过MKL转换接口将其转为CSR格式;
  3. 执行稀疏矩阵csrA与稠密矩阵denseB的乘积,使用mkl_sparse_s_mm接口计算矩阵乘法,结果为稠密矩阵C;
  4. 将计算结果转为需要的尺寸(此例为二维数组)返回。

稀疏矩阵coo乘稠密矩阵接口

/*
输入:
ia  稀疏矩阵A的行索引,一维MKL整型
ja  稀疏矩阵A的列索引,一维MKL整型
a  稀疏矩阵A的数据值,一维浮点型
nnz	非零元素个数
denseB  稠密矩阵B数据,类型为float型的二维数组
rowsA  稀疏矩阵A的行数
colsA  稀疏矩阵A的列数
colsC  A、B两矩阵相乘结果C的列数
flag 对稀疏矩阵A的操作,选项为0、1、2。0-A  1-AT(A矩阵的转置)  2-AH(A矩阵的共轭转置) 默认为0
allocType  二维矩阵定义方式,
        allocType=0时,定义为A=alloc(row,col), A[col][row](第一维表示列,第二维表示行)
        allocType=1时,定义为A=alloc(col,row), A[row][col](第一维表示行,第二维表示列)
输出:
denseC  稠密矩阵C数据,为A与B相乘后的结果,类型为float型的二维数组
*/
bool MKL_Sparse_CooXDense(MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, float *a, int nnz, float **denseB, float **denseC, int rowsA, int colsA, int colsC, int flag, int allocType);

函数代码

bool MKL_Sparse_CooXDense(MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, float *a, int nnz, float **denseB, float **denseC, int rowsA, int colsA, int colsC, int flag, int allocType) {

	//生成csr格式稀疏矩阵
	sparse_matrix_t csrA, cooA;
	sparse_status_t status = mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		rowsA,    // number of rows
		colsA,    // number of cols
		nnz,  // number of nonzeros
		ia,
		ja,
		a);
	if (status != SPARSE_STATUS_SUCCESS) {
		printf("Error creating COO sparse matrix.\n");
	}
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);

	//调用mkl稀疏矩阵与稠密矩阵乘法  C=alpha*op(A)*B+beta*C
	double alpha = 1.0;
	double beta = 0.0;
	int M, N, K;
	int ncols, ldx, ldy;

	if (allocType == 0) {

		if (flag == 1 || flag == 2) {	//转置或共轭转置,AT或AH
			M = colsA;
			N = rowsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = N;
			ldy = M;
		}
		else {	//默认的情况下,A
			M = rowsA;
			N = colsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = N;
			ldy = M;
		}
		//将二维稠密矩阵B转为一维
		float *denseB1D = (float*)mkl_malloc(N*K * sizeof(float), 64);
		for (int i = 0; i < K; i++) {
			memcpy(denseB1D + i * N, denseB[i], N * sizeof(float));
		}

		struct matrix_descr descr = { SPARSE_MATRIX_TYPE_GENERAL, SPARSE_FILL_MODE_FULL, SPARSE_DIAG_NON_UNIT };

		float *denseC1D = (float*)mkl_malloc(M * K * sizeof(float), 64);
		sparse_operation_t operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;  //默认 op(A)=A;
		if (flag == 0) {   //稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		if (flag == 1) {//稀疏矩阵 op(A)=AT
			operation = SPARSE_OPERATION_TRANSPOSE;
		}
		else if (flag == 2)
		{    //稀疏矩阵 op(A)=AH
			operation = SPARSE_OPERATION_CONJUGATE_TRANSPOSE;
		}
		else {//稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		mkl_sparse_s_mm(operation, alpha, csrA, descr, SPARSE_LAYOUT_COLUMN_MAJOR, denseB1D, ncols, ldx, beta, denseC1D, ldy);

		//将计算结果转为2维
		for (int i = 0; i < K; i++) {
			memcpy(denseC[i], denseC1D + i * M, M * sizeof(float));
		}
		mkl_free(denseB1D);
		mkl_free(denseC1D);
	}

	if (allocType == 1) {

		if (flag == 1 || flag == 2) {	//转置或共轭转置,AT或AH
			M = colsA;
			N = rowsA;
			K = colsC;
			ncols = K;
			ldx = K;
			ldy = K;
		}
		else {	//默认的情况下,A
			M = rowsA;
			N = colsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = K;
			ldy = K;
		}
		//将二维稠密矩阵B转为一维
		float *denseB1D = (float*)mkl_malloc(N*K * sizeof(float), 64);
		for (int i = 0; i < N; i++) {
			memcpy(denseB1D + i * K, denseB[i], K * sizeof(float));
		}

		struct matrix_descr descr = { SPARSE_MATRIX_TYPE_GENERAL, SPARSE_FILL_MODE_FULL, SPARSE_DIAG_NON_UNIT };

		float *denseC1D = (float*)mkl_malloc(M * K * sizeof(float), 64);
		sparse_operation_t operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;  //默认 op(A)=A;
		if (flag == 0) {   //稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		if (flag == 1) {//稀疏矩阵 op(A)=AT
			operation = SPARSE_OPERATION_TRANSPOSE;
		}
		else if (flag == 2)
		{    //稀疏矩阵 op(A)=AH
			operation = SPARSE_OPERATION_CONJUGATE_TRANSPOSE;
		}
		else {//稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		mkl_sparse_s_mm(operation, alpha, csrA, descr, SPARSE_LAYOUT_ROW_MAJOR, denseB1D, ncols, ldx, beta, denseC1D, ldy);

		//将计算结果转为2维
		for (int i = 0; i < M; i++) {
			memcpy(denseC[i], denseC1D + i * K, K * sizeof(float));
		}
		mkl_free(denseB1D);
		mkl_free(denseC1D);
	}

	//释放
	mkl_sparse_destroy(csrA);
	mkl_sparse_destroy(cooA);

	return true;

}

执行main.cpp中的MKL_Sparse_CooXDense_Demo()后,

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

(3)稀疏矩阵X稀疏矩阵

两个稀疏矩阵的乘法,使用mkl_sparse_spmm接口实现\(C = op(A) * B\),该接口的用法相对简单,

mkl_sparse_spmm(SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE,//是否对A矩阵进行操作
                csrA, 	//A矩阵,CSR格式
                csrB,	//B矩阵,CSR格式
                &csrC	//C矩阵,CSR格式
               );

在进行稀疏矩阵示例之前,先补充两个封装函数:MKL_Coo2Csr()Print_Sparse_Csr_Matrix()

/*
函数功能:根据已知坐标、元素值,创建CSR稀疏矩阵
输入:
float *a    稀疏矩阵的值  ----参照稀疏矩阵的coo格式
MKL_INT *ia  稀疏矩阵的行指针
MKL_INT *ja  稀疏矩阵的列索引
int     nnz  稀疏矩阵的数量
int     nrows稀疏矩阵的行数
int     ncols稀疏矩阵的列数
输出:
sparse_matrix_t   CSR格式稀疏矩阵
*/
sparse_matrix_t MKL_Coo2Csr(int* ia, int *ja, float *a, int nrows, int ncols, int nnz) {

	//建立coo矩阵A 与 csrA矩阵
	sparse_matrix_t cooA, csrA;

	mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		nrows,    // number of rows
		ncols,    // number of cols
		nnz,  // number of nonzeros
		ia,
		ja,
		a);

	//coo转csr
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);

	//释放cooA矩阵
	mkl_sparse_destroy(cooA);

	//返回csrA矩阵
	return csrA;
}

/*
函数功能:打印CSR稀疏矩阵的前n行n列元素
输入:
sparse_matrix_t   CSR格式稀疏矩阵
int m   前m行
int n	前n列
*/

void Print_Sparse_Csr_Matrix(sparse_matrix_t csrA,int m,int n) {
	sparse_index_base_t indexing;
	int nrows;
	int ncols;
	MKL_INT* csr_row_start;
	MKL_INT* csr_row_end;
	MKL_INT* csr_col_indx;
	float* csr_values;

	mkl_sparse_s_export_csr(csrA, &indexing, &nrows, &ncols, &csr_row_start, &csr_row_end, &csr_col_indx, &csr_values);

	float **A_dense = alloc2float(ncols, nrows);
	memset(A_dense[0], 0, nrows*ncols * sizeof(float));

	//将value转换为普通二维数组
	for (int i = 0; i < nrows; i++) {
		for (int j = csr_row_start[i]; j < csr_row_start[i + 1]; j++) {
			A_dense[i][csr_col_indx[j]] = csr_values[j];
		}
	}
	//输出稠密矩阵
	for (int i = 0; i < m; i++) {
		for (int j = 0; j < n; j++) {
			printf("%f ", A_dense[i][j]);
		}
		printf("\n");
	}
	free2float(A_dense);
}

稀疏矩阵(csr)乘稀疏矩阵(csr)接口

/*
输入:
float *a    稀疏矩阵A的属性  ----参照稀疏矩阵的coo格式
MKL_INT *ia  
MKL_INT *ja  
int     nnzA 
int    rowsA 
int    colsA 
float *b    稀疏矩阵B的属性  ----参照稀疏矩阵的coo格式
MKL_INT *ib  
MKL_INT *jb  
int     nnzB 
int    rowsB 
int    colsB 

输出:
sparse_matrix_t  稀疏矩阵C(A*B)
*/
sparse_matrix_t MKL_Sparse_CooXCoo(
	int* ia, int *ja, float *a, int rowsA, int colsA, int nnzA,
	int* ib, int *jb, float *b, int rowsB, int colsB, int nnzB);

函数代码

sparse_matrix_t MKL_Sparse_CooXCoo(
	int* ia, int *ja, float *a, int rowsA, int colsA, int nnzA,
	int* ib, int *jb, float *b, int rowsB, int colsB, int nnzB) {

	//根据坐标创建csrA和csrB
	sparse_matrix_t csrA, csrB, csrC;
	csrA = MKL_Coo2Csr(ia, ja, a, rowsA, colsA, nnzA);
	csrB = MKL_Coo2Csr(ib, jb, b, rowsB, colsB, nnzB);

	//csrC创建
	mkl_sparse_d_create_csr(&csrC,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		rowsA,    // number of rows
		colsB,    // number of cols
		NULL,  // number of nonzeros
		NULL,
		NULL,
		NULL);
        //MKL乘法
	mkl_sparse_spmm(SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, csrA, csrB, &csrC);
	//释放矩阵A和B
	mkl_sparse_destroy(csrA);
	mkl_sparse_destroy(csrB);
	return csrC;
}

执行main.cpp中的MKL_Sparse_CooXCoo_Demo()后,

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

计算结果与matlab结果一致。

2 稀疏矩阵求逆

(1)matlab计算结果

作为标准答案,验证后续调用的正确性。

A = [1 2 4 0 0; 
    2 2 0 0 0;
    4 0 3 0 0;
    0 0 0 4 0;
    0 0 0 0 5];

A_inv = inv(A)

输出为:

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

(2)MKL计算

MKL的求逆计算相对复杂,以下将介绍MKL中的高性能稀疏线性方程组求解器PARDISO(Parallel Direct Sparse Solver Interface),PARDISO 实现了高效的并行算法和内存管理技术,可以处理大规模、高度稀疏的线性方程组求解,并具有高性能和可扩展性。

PARDISO 的求解过程包括以下几个步骤:

  1. 输入矩阵:提供线性方程组的稀疏矩阵\(A\),稀疏CSR格式。
  2. 分析矩阵:对矩阵进行预处理和分解,生成求解器所需的数据结构和信息,包括消元树、消元顺序、LU 分解等。
  3. 求解线性方程组:使用 LU 分解求解线性方程组,可以直接求解$ A X = B \(或者\) AX = λX $问题。
  4. 输出解向量:输出求解得到的解向量 \(X\)

在我们使用PARDISO接口求逆时,思路为将\(B\)设为单位阵,此时求解\(X\)即为矩阵\(A\)的逆\(A^{-1}\)

关于PARDISO接口参数的详细描述参考oneMKL PARDISO Parameters in Tabular Form (intel.com),以下简单介绍:

PARDISO(pt, &maxfct, &mnum, &mtype, &phase, &n, a, ia, ja, &perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);
  1. pt:指向PARDISO内部数据结构的指针。数组长度为64,必须用零初始化,并且不再改动。

  2. maxfct:最大因子数,通常设置为1。

  3. mnum:与maxfct一起使用,用于区分不同的矩阵。

  4. mtype:矩阵类型。具体取值如下:

    • 1 - 实对称矩阵;
    • 2 - 实对称正定矩阵;
    • -2 - 实对称不定矩阵;
    • 3 - 复对称矩阵;
    • 11 - 实数、非对称矩阵;
  5. phase:指定PARDISO的阶段。具体取值如:

    • 11-分析阶段;
    • 12-分析、数值分解阶段;
    • 13-分析、数值分解、求解阶段;
    • 22-数值分解阶段;
    • 23-数值分解、求解阶段;
    • 33-求解、迭代阶段;
    • -1-释放所有矩阵内存;
  6. n:\(AX=B\)的方程个数,简记为矩阵\(A\)的行。

  7. a:稀疏矩阵\(A\)的非零元素(CSR格式中的values)。

  8. ia:CSR格式中的行索引。

  9. ja:CSR格式中的列索引。

  10. perm:保存大小为 n 的置换向量。

  11. nrhs:官方解释为:需要求解的右侧数(Number of right-hand sides that need to be solved for),一般为1。

  12. iparm:iparm是PARDISO中的一个长度为64的整数数组,用于控制PARDISO求解器的行为。iparm中每个参数的详细说明参见pardiso iparm Parameter (intel.com),以下仅列出一些常用且便于理解的参数:

    • iparm[0]:0-使用默认值,非0-使用自定义参数;
    • iparm[11]:对稀疏矩阵A进行操作后求解。0-求解\(AX=B\),1-求解\(A^HX=B\),2-求解\(A^TX=B\)
    • iparm[12]: 使用(非)对称加权匹配提高准确性,0-禁用,1-开启;
    • iparm[27]: 单精度/双精度,0-double,1-float;
    • iparm[34]: 以0或1作为初始索引,0-从1开始索引,1-从0开始索引;
  13. msglvl:Message level information,0-不生成输出,1-打印计算信息。

  14. b:\(B\)矩阵。

  15. x:\(X\)矩阵。

  16. error:错误代码。

稀疏矩阵求逆接口

/*
输入:
float *a    稀疏矩阵的值  ----参照稀疏矩阵的csr格式
MKL_INT *ia  稀疏矩阵的行指针
MKL_INT *ja  稀疏矩阵的列索引
int     nnz  稀疏矩阵的数量
int     n    稀疏矩阵的维度 n*n
MKL_INT mtype 稀疏矩阵类型
输出:
float **Ainv   [稠密矩阵]稀疏矩阵的逆 n*n   
*/
bool MKL_Sparse_Inverse(float **Ainv, float *a, MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, int nnz, int n,MKL_INT mtype);

函数代码

在代码中对求逆步骤进行解释

bool MKL_Sparse_Inverse(float **Ainv, float *a, MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, int nnz, int n, MKL_INT mtype) {
	/*STEP1 根据输入数组创建COO格式稀疏矩阵*/
    
	//由于CSR格式不易表示,所以采取的路线为通过坐标创建COO格式矩阵
	//再通过mkl接口将COO矩阵转为CSR矩阵
	sparse_matrix_t csrA, cooA;

	sparse_status_t status = mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		n,    // 稀疏矩阵的行、列
		n,
		nnz,  // 非零元素个数
		ia,//行索引                                      
		ja,//列索引
		a);//矩阵元素值
	if (status != SPARSE_STATUS_SUCCESS) {
		printf("Error creating COO sparse matrix.\n");
	}
	//coo转csr格式
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);
	/*STEP2 根据CSR格式稀疏矩阵得到其ia,ja,a三组数据*/
	sparse_index_base_t indexing;
	int nrows;
	int ncols;
	MKL_INT* ia_csr = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);//csr格式的行指针
	MKL_INT* csr_row_end = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT* ja_csr = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);//csr格式的列索引
	float* a_csr = (float*)mkl_malloc(nnz * sizeof(float), 64);//csr格式的矩阵值
	//利用mkl_sparse_s_export_csr接口实现
	mkl_sparse_s_export_csr(csrA, &indexing, &nrows, &ncols, &ia_csr, &csr_row_end, &ja_csr, &a_csr);

	/*Step3 设置稀疏矩阵参数*/
	//初始化B矩阵和X矩阵
	float *b = NULL;   //保存单位矩阵用于求逆
	float *x = NULL;   //解矩阵
	b = (float*)mkl_malloc(n*n * sizeof(float), 64);
	x = (float*)mkl_malloc(n*n * sizeof(float), 64);
	//将B矩阵初始化为单位阵
	for (int i = 0; i < n; i++) {
		for (int j = 0; j < n; j++) {
			if (i == j) {
				b[i*n + j] = 1;
			}
			else {
				b[i*n + j] = 0;
			}
		}
	}

	//初始化pt
	void *pt[64];
	for (int i = 0; i < 64; i++)
	{
		pt[i] = 0;
	}

	//初始化矩阵相关控制参数
	MKL_INT maxfct = 1;
	MKL_INT mnum = 1;
	MKL_INT phase = 1;
	MKL_INT perm = 0;
	MKL_INT nrhs = n;
	MKL_INT error = 0;
	MKL_INT msglvl = 0;

	//设置iparm参数
	MKL_INT iparm[64];
	//批量初始化
	for (int i = 0; i < 64; i++)
	{
		iparm[i] = 0;
	}
	iparm[0] = 1;	//开启自定义
	iparm[12] = 1;  //提高准确性
	iparm[27] = 1;  //为float型
	iparm[34] = 1;  //初始索引为0

	/*Step4 分析矩阵、数值分解、求解*/
	phase = 13;	//phase设置为13,表示分析、数值分解、求解阶段

	PARDISO(pt, &maxfct, &mnum, &mtype, &phase, &n, a_csr, ia_csr, ja_csr, &perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);

	//将解矩阵copy给输出,即A的逆矩阵
	for (int i = 0; i < n; i++) {
		memcpy(Ainv[i], x + i * n, n * sizeof(float));
	}
	//释放矩阵内存
	phase = -1;           //phase设置为-1
	PARDISO(pt, &maxfct, &mnum, &mtype, &phase, &n, a_csr, ia_csr, ja_csr, &perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);

	//释放内存
	mkl_sparse_destroy(cooA);
	mkl_sparse_destroy(csrA);

	mkl_free(x);
	mkl_free(b);

	return true;
}

在执行main.cpp中的MKL_Sparse_Inverse_Demo()之后,输出如下,与matlab结果一致:文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-422792.html

MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装

完整代码

Ⅰ MKL_Sparse_Methods.h

#pragma once

#include<stdio.h>
#include<stdlib.h>
#include "alloc.h"
#include"mkl.h"
#include "mkl_types.h"
#include"mkl_lapacke.h"
#include "mkl_spblas.h"

bool MKL_Sparse_CooXDense(MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, float *a, int nnz, float **denseB, float **denseC, int rowsA, int colsA, int colsC, int flag, int allocType);
sparse_matrix_t MKL_Sparse_CooXCoo(
	int* ia, int *ja, float *a, int rowsA, int colsA, int nnzA,
	int* ib, int *jb, float *b, int rowsB, int colsB, int nnzB);
sparse_matrix_t MKL_Coo2Csr(int* ia, int *ja, float *a, int nrows, int ncols, int nnz);
void Print_Sparse_Csr_Matrix(sparse_matrix_t csrA,int m,int n);
bool MKL_Sparse_Inverse(float **Ainv, float *a, MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, int nnz, int n, MKL_INT mtype);

Ⅱ MKL_Sparse_Methods.cpp

#include "MKL_Sparse_Methods.h"

bool MKL_Sparse_CooXDense(MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, float *a, int nnz, float **denseB, float **denseC, int rowsA, int colsA, int colsC, int flag, int allocType) {

	//生成csr格式稀疏矩阵
	sparse_matrix_t csrA, cooA;
	sparse_status_t status = mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		rowsA,    // number of rows
		colsA,    // number of cols
		nnz,  // number of nonzeros
		ia,
		ja,
		a);
	if (status != SPARSE_STATUS_SUCCESS) {
		printf("Error creating COO sparse matrix.\n");
	}
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);

	//调用mkl稀疏矩阵与稠密矩阵乘法  C=alpha*op(A)*B+beta*C
	double alpha = 1.0;
	double beta = 0.0;
	int M, N, K;
	int ncols, ldx, ldy;

	if (allocType == 0) {

		if (flag == 1 || flag == 2) {	//转置或共轭转置,AT或AH
			M = colsA;
			N = rowsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = N;
			ldy = M;
		}
		else {	//默认的情况下,A
			M = rowsA;
			N = colsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = N;
			ldy = M;
		}
		//将二维稠密矩阵B转为一维
		float *denseB1D = (float*)mkl_malloc(N*K * sizeof(float), 64);
		for (int i = 0; i < K; i++) {
			memcpy(denseB1D + i * N, denseB[i], N * sizeof(float));
		}

		struct matrix_descr descr = { SPARSE_MATRIX_TYPE_GENERAL, SPARSE_FILL_MODE_FULL, SPARSE_DIAG_NON_UNIT };

		float *denseC1D = (float*)mkl_malloc(M * K * sizeof(float), 64);
		sparse_operation_t operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;  //默认 op(A)=A;
		if (flag == 0) {   //稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		if (flag == 1) {//稀疏矩阵 op(A)=AT
			operation = SPARSE_OPERATION_TRANSPOSE;
		}
		else if (flag == 2)
		{    //稀疏矩阵 op(A)=AH
			operation = SPARSE_OPERATION_CONJUGATE_TRANSPOSE;
		}
		else {//稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		mkl_sparse_s_mm(operation, alpha, csrA, descr, SPARSE_LAYOUT_COLUMN_MAJOR, denseB1D, ncols, ldx, beta, denseC1D, ldy);

		//将计算结果转为2维
		for (int i = 0; i < K; i++) {
			memcpy(denseC[i], denseC1D + i * M, M * sizeof(float));
		}
		mkl_free(denseB1D);
		mkl_free(denseC1D);
	}

	if (allocType == 1) {

		if (flag == 1 || flag == 2) {	//转置或共轭转置,AT或AH
			M = colsA;
			N = rowsA;
			K = colsC;
			ncols = K;
			ldx = K;
			ldy = K;
		}
		else {	//默认的情况下,A
			M = rowsA;
			N = colsA;
			K = colsC;
			ncols = N;
			ldx = K;
			ldy = K;
		}
		//将二维稠密矩阵B转为一维
		float *denseB1D = (float*)mkl_malloc(N*K * sizeof(float), 64);
		for (int i = 0; i < N; i++) {
			memcpy(denseB1D + i * K, denseB[i], K * sizeof(float));
		}

		struct matrix_descr descr = { SPARSE_MATRIX_TYPE_GENERAL, SPARSE_FILL_MODE_FULL, SPARSE_DIAG_NON_UNIT };

		float *denseC1D = (float*)mkl_malloc(M * K * sizeof(float), 64);
		sparse_operation_t operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;  //默认 op(A)=A;
		if (flag == 0) {   //稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		if (flag == 1) {//稀疏矩阵 op(A)=AT
			operation = SPARSE_OPERATION_TRANSPOSE;
		}
		else if (flag == 2)
		{    //稀疏矩阵 op(A)=AH
			operation = SPARSE_OPERATION_CONJUGATE_TRANSPOSE;
		}
		else {//稀疏矩阵 op(A)=A 
			operation = SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE;
		}
		mkl_sparse_s_mm(operation, alpha, csrA, descr, SPARSE_LAYOUT_ROW_MAJOR, denseB1D, ncols, ldx, beta, denseC1D, ldy);

		//将计算结果转为2维
		for (int i = 0; i < M; i++) {
			memcpy(denseC[i], denseC1D + i * K, K * sizeof(float));
		}
		mkl_free(denseB1D);
		mkl_free(denseC1D);
	}

	//释放
	mkl_sparse_destroy(csrA);
	mkl_sparse_destroy(cooA);

	return true;

}

//根据已知坐标、元素值,创建CSR稀疏矩阵
sparse_matrix_t MKL_Coo2Csr(int* ia, int *ja, float *a, int nrows, int ncols, int nnz) {

	//建立coo矩阵A 与 csrA矩阵
	sparse_matrix_t cooA, csrA;

	mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		nrows,    // number of rows
		ncols,    // number of cols
		nnz,  // number of nonzeros
		ia,
		ja,
		a);

	//coo转csr
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);

	//释放cooA矩阵
	mkl_sparse_destroy(cooA);

	//返回csrA矩阵
	return csrA;
}

void Print_Sparse_Csr_Matrix(sparse_matrix_t csrA,int m,int n) {
	sparse_index_base_t indexing;
	int nrows;
	int ncols;
	MKL_INT* csr_row_start;
	MKL_INT* csr_row_end;
	MKL_INT* csr_col_indx;
	float* csr_values;

	mkl_sparse_s_export_csr(csrA, &indexing, &nrows, &ncols, &csr_row_start, &csr_row_end, &csr_col_indx, &csr_values);

	float **A_dense = alloc2float(ncols, nrows);
	memset(A_dense[0], 0, nrows*ncols * sizeof(float));

	//将value转换为普通二维数组
	for (int i = 0; i < nrows; i++) {
		for (int j = csr_row_start[i]; j < csr_row_start[i + 1]; j++) {
			A_dense[i][csr_col_indx[j]] = csr_values[j];
		}
	}
	//输出稠密矩阵
	for (int i = 0; i < m; i++) {
		for (int j = 0; j < n; j++) {
			printf("%f ", A_dense[i][j]);
		}
		printf("\n");
	}
	free2float(A_dense);
}

//Coo格式×Coo格式矩阵乘法
sparse_matrix_t MKL_Sparse_CooXCoo(
	int* ia, int *ja, float *a, int rowsA, int colsA, int nnzA,
	int* ib, int *jb, float *b, int rowsB, int colsB, int nnzB) {

	//根据坐标创建csrA和csrB
	sparse_matrix_t csrA, csrB, csrC;
	csrA = MKL_Coo2Csr(ia, ja, a, rowsA, colsA, nnzA);
	csrB = MKL_Coo2Csr(ib, jb, b, rowsB, colsB, nnzB);

	//csrC创建
	mkl_sparse_d_create_csr(&csrC,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		rowsA,    // number of rows
		colsB,    // number of cols
		NULL,  // number of nonzeros
		NULL,
		NULL,
		NULL);
	mkl_sparse_spmm(SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, csrA, csrB, &csrC);
	//释放矩阵A和B
	mkl_sparse_destroy(csrA);
	mkl_sparse_destroy(csrB);
	return csrC;
}

//稀疏矩阵求逆
bool MKL_Sparse_Inverse(float **Ainv, float *a, MKL_INT *ia, MKL_INT *ja, int nnz, int n, MKL_INT mtype) {
	/*STEP1 根据输入数组创建COO格式稀疏矩阵*/
//由于CSR格式不易表示,所以采取的路线为通过坐标创建COO格式矩阵
//再通过mkl接口将COO矩阵转为CSR矩阵
	sparse_matrix_t csrA, cooA;

	sparse_status_t status = mkl_sparse_s_create_coo(&cooA,
		SPARSE_INDEX_BASE_ZERO,
		n,    // 稀疏矩阵的行、列
		n,
		nnz,  // 非零元素个数
		ia,//行索引                                      
		ja,//列索引
		a);//矩阵元素值
	if (status != SPARSE_STATUS_SUCCESS) {
		printf("Error creating COO sparse matrix.\n");
	}
	//coo转csr格式
	mkl_sparse_convert_csr(cooA, SPARSE_OPERATION_NON_TRANSPOSE, &csrA);
	/*STEP2 根据CSR格式稀疏矩阵得到其ia,ja,a三组数据*/
	sparse_index_base_t indexing;
	int nrows;
	int ncols;
	MKL_INT* ia_csr = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);//csr格式的行指针
	MKL_INT* csr_row_end = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT* ja_csr = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);//csr格式的列索引
	float* a_csr = (float*)mkl_malloc(nnz * sizeof(float), 64);//csr格式的矩阵值
	//利用mkl_sparse_s_export_csr接口实现
	mkl_sparse_s_export_csr(csrA, &indexing, &nrows, &ncols, &ia_csr, &csr_row_end, &ja_csr, &a_csr);

	/*Step3 设置稀疏矩阵参数*/
	//初始化B矩阵和X矩阵
	float *b = NULL;   //保存单位矩阵用于求逆
	float *x = NULL;   //解矩阵
	b = (float*)mkl_malloc(n*n * sizeof(float), 64);
	x = (float*)mkl_malloc(n*n * sizeof(float), 64);
	//将B矩阵初始化为单位阵
	for (int i = 0; i < n; i++) {
		for (int j = 0; j < n; j++) {
			if (i == j) {
				b[i*n + j] = 1;
			}
			else {
				b[i*n + j] = 0;
			}
		}
	}

	//初始化pt
	void *pt[64];
	for (int i = 0; i < 64; i++)
	{
		pt[i] = 0;
	}

	//初始化矩阵相关控制参数
	MKL_INT maxfct = 1;
	MKL_INT mnum = 1;
	MKL_INT phase = 1;
	MKL_INT perm = 0;
	MKL_INT nrhs = n;
	MKL_INT error = 0;
	MKL_INT msglvl = 0;

	//设置iparm参数
	MKL_INT iparm[64];
	//批量初始化
	for (int i = 0; i < 64; i++)
	{
		iparm[i] = 0;
	}
	iparm[0] = 1;	//开启自定义
	iparm[12] = 1;  //提高准确性
	iparm[27] = 1;  //为float型
	iparm[34] = 1;  //初始索引为0

	/*Step4 分析矩阵、数值分解、求解*/
	phase = 13;	//phase设置为13,表示分析、数值分解、求解阶段
	PARDISO(pt, &maxfct, &mnum, &mtype, &phase, &n, a_csr, ia_csr, ja_csr, &perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);

	//将解矩阵copy给输出,即A的逆矩阵
	for (int i = 0; i < n; i++) {
		memcpy(Ainv[i], x + i * n, n * sizeof(float));
	}
	//释放矩阵内存
	phase = -1;           //phase设置为-1
	PARDISO(pt, &maxfct, &mnum, &mtype, &phase, &n, a_csr, ia_csr, ja_csr, &perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);

	//释放内存
	mkl_sparse_destroy(cooA);
	mkl_sparse_destroy(csrA);

	mkl_free(x);
	mkl_free(b);

	return true;
}

Ⅲ main.cpp

#include "MKL_Sparse_Methods.h"
#include "alloc.h"

#define M 6
#define N 5
#define K 4

void MKL_Sparse_CooXDense_Demo();
void MKL_Sparse_CooXCoo_Demo();
void MKL_Sparse_Inverse_Demo();

int main() {
    MKL_Sparse_CooXDense_Demo();//稀疏乘稠密
    MKL_Sparse_CooXCoo_Demo();	//稀疏×稀疏
    MKL_Sparse_Inverse_Demo();//稀疏矩阵求逆
    return 0;
}

//稀疏乘稠密
void MKL_Sparse_CooXDense_Demo() {
	int flag = 0;	/*	flag=0时表示A(COO)*B(Dense)
				flag=1时表示AT(COO)*B(Dense)*/
	int rowsA, colsA;
	if (flag == 0) {
		rowsA = M, colsA = N;
	}
	else if (flag == 1) {
		rowsA = N, colsA = M;
	}

	int rowsB = N, colsB = K;
	int rowsC = M, colsC = K;

	float Atemp[M][N] = {
	{1,-1,-3,0,0},
	{-2,5,0,0,0},
	{0,0,4,6,4},
	{-4,0,2,7,0},
	{0,8,0,0,-5},
	{1,0,0,0,0},
	};

	float ATtemp[N][M] = {
	{1,-2,0,-4,0,1},
	{-1,5,0,0,8,0},
	{-3,0,4,2,0,0},
	{0,0,6,7,0,0},
	{0,0,4,0,-5,0},
	};

	float Btemp[N][K] = {
	{1,-1,-3,0},
	{-2,5,0,0},
	{0,0,4,6},
	{-4,0,2,7},
	{0,8,0,0}
	};

	int allocType = 1;
	//将一般二维数组转换为alloc表示
	float **matrixA = alloc2float(colsA, rowsA);
	memset(matrixA[0], 0, rowsA*colsA * sizeof(float));
	float **matrixB = alloc2float(colsB, rowsB);
	memset(matrixB[0], 0, rowsB*colsB * sizeof(float));
	float **matrixC = alloc2float(colsC, rowsC);
	memset(matrixC[0], 0, rowsC*colsC * sizeof(float));


	//复制二维数组到二级指针
	if (flag == 0) {
		memcpy(matrixA[0], Atemp, rowsA*colsA * sizeof(float));
	}
	else if (flag == 1) {
		memcpy(matrixA[0], ATtemp, rowsA*colsA * sizeof(float));
	}

	memcpy(matrixB[0], Btemp, rowsB*colsB * sizeof(float));

	//统计二维数组的非零元素个数
	int nnz = 0;
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			//统计nnz
			if (matrixA[i][j] != 0) {
				nnz++;
			}
		}
	}

	//获取稠密矩阵的coo形式
	MKL_INT *ia = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT *ja = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	float *a = (float*)mkl_malloc(nnz * sizeof(float), 64);

	//获取coo数据
	int k = 0;
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			if (matrixA[i][j] != 0.0) {
				a[k] = matrixA[i][j];
				ia[k] = i;
				ja[k] = j;
				k++;
			}
		}
	}

	//执行矩阵乘法
	MKL_Sparse_CooXDense(ia, ja, a, nnz, matrixB, matrixC, rowsA, colsA, colsC, flag, allocType);

	/* 输出结果 */
	printf("*************** MKL Sparse X Dense ***************\n ");
	printf("===============  flag=%d  ================\n", flag);
	for (int i = 0; i < rowsC; i++) {
		for (int j = 0; j < colsC; j++) {
			printf("%f ", matrixC[i][j]);
		}
		printf("\n");
	}

	free2float(matrixA);
	free2float(matrixB);
	free2float(matrixC);
	mkl_free(ia);
	mkl_free(ja);
	mkl_free(a);

}

//稀疏×稀疏
void MKL_Sparse_CooXCoo_Demo() {

	int rowsA = M, colsA = N;
	int rowsB = N, colsB = K;
	int rowsC = M, colsC = K;

	float Atemp[M][N] = {
	{1,-1,-3,0,0},
	{-2,5,0,0,0},
	{0,0,4,6,4},
	{-4,0,2,7,0},
	{0,8,0,0,-5},
	{1,0,0,0,0},
	};

	float Btemp[N][K] = {
	{1,-1,-3,0},
	{-2,5,0,0},
	{0,0,4,6},
	{-4,0,2,7},
	{0,8,0,0}
	};

	//将一般二维数组转换为alloc表示
	float **matrixA = alloc2float(colsA, rowsA);
	memset(matrixA[0], 0, rowsA*colsA * sizeof(float));
	float **matrixB = alloc2float(colsB, rowsB);
	memset(matrixB[0], 0, rowsB*colsB * sizeof(float));
	//复制二维数组到二级指针
	memcpy(matrixA[0], Atemp, rowsA*colsA * sizeof(float));
	memcpy(matrixB[0], Btemp, rowsB*colsB * sizeof(float));

	//***********A矩阵稀疏表示
	//统计二维数组的非零元素个数
	int nnzA = 0;	//A矩阵
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			//统计nnz
			if (matrixA[i][j] != 0) {
				nnzA++;
			}
		}
	}
	//获取稠密矩阵的coo形式
	MKL_INT *ia = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnzA * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT *ja = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnzA * sizeof(MKL_INT), 64);
	float *a = (float*)mkl_malloc(nnzA * sizeof(float), 64);

	//获取coo数据
	int k = 0;
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			if (matrixA[i][j] != 0.0) {
				a[k] = matrixA[i][j];
				ia[k] = i;
				ja[k] = j;
				k++;
			}
		}
	}
	//***********B矩阵稀疏表示
	int nnzB = 0;	//B矩阵
	for (int i = 0; i < rowsB; i++) {
		for (int j = 0; j < colsB; j++) {
			//统计nnz
			if (matrixB[i][j] != 0) {
				nnzB++;
			}
		}
	}
	//获取稠密矩阵的coo形式
	MKL_INT *ib = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnzB * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT *jb = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnzB * sizeof(MKL_INT), 64);
	float *b = (float*)mkl_malloc(nnzB * sizeof(float), 64);

	//获取coo数据
	k = 0;
	for (int i = 0; i < rowsB; i++) {
		for (int j = 0; j < colsB; j++) {
			if (matrixB[i][j] != 0.0) {
				b[k] = matrixB[i][j];
				ib[k] = i;
				jb[k] = j;
				k++;
			}
		}
	}

	sparse_matrix_t csrC = MKL_Sparse_CooXCoo(ia, ja, a, rowsA, colsA, nnzA, ib, jb, b, rowsB, colsB, nnzB);
	printf("*************** MKL Sparse X Sparse ***************\n ");
	Print_Sparse_Csr_Matrix(csrC, rowsC, colsC);	//打印矩阵C结果

	mkl_sparse_destroy(csrC);

	mkl_free(ia);
	mkl_free(ja);
	mkl_free(a);
	mkl_free(ib);
	mkl_free(jb);
	mkl_free(b);
	free2float(matrixA);
	free2float(matrixB);
}

//稀疏矩阵求逆
void MKL_Sparse_Inverse_Demo() {
	int rowsA = N, colsA = N;

	float Atemp[N][N] = {
	{1,2,4,0,0},
	{2,2,0,0,0},
	{4,0,3,0,0},
	{0,0,0,4,0},
	{0,0,0,0,5},
	};


	//将一般二维数组转换为alloc表示
	float **matrixA = alloc2float(colsA, rowsA);
	memset(matrixA[0], 0, rowsA*colsA * sizeof(float));
	float **matrixA_inv = alloc2float(colsA, rowsA);
	memset(matrixA[0], 0, rowsA*colsA * sizeof(float));

	//复制二维数组到二级指针
	memcpy(matrixA[0], Atemp, rowsA*colsA * sizeof(float));

	//统计二维数组的非零元素个数
	int nnz = 0;
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			//统计nnz
			if (matrixA[i][j] != 0) {
				nnz++;
			}
		}
	}
	//获取稠密矩阵的coo形式
	MKL_INT *ia = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	MKL_INT *ja = (MKL_INT*)mkl_malloc(nnz * sizeof(MKL_INT), 64);
	float *a = (float*)mkl_malloc(nnz * sizeof(float), 64);

	//获取coo数据
	int k = 0;
	for (int i = 0; i < rowsA; i++) {
		for (int j = 0; j < colsA; j++) {
			if (matrixA[i][j] != 0.0) {
				a[k] = matrixA[i][j];
				ia[k] = i;
				ja[k] = j;
				k++;
			}
		}
	}
	MKL_INT mtype = 11;	//设置矩阵类型为一般实矩阵
	MKL_Sparse_Inverse(matrixA, a, ia, ja, nnz, rowsA, mtype);
	printf("*************** MKL Sparse Matrix Inverse ***************\n ");
	for (int i = 0; i < N; i++) {
		for (int j = 0; j < N; j++) {
			printf("%f ", matrixA[i][j]);
		}
		printf("\n");
	}
	free2float(matrixA);
	free2float(matrixA_inv);
	mkl_free(ia);
	mkl_free(ja);
	mkl_free(a);
}

到了这里,关于MKL稀疏矩阵运算示例及函数封装的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

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