蛋白质组学两个定量方法（iBAQ和LFQ）的区别及常见的标准化方法

9月前作者：Xiaofei@IDO 分类：Toy博客阅读(37) 违法举报

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了蛋白质组学两个定量方法（iBAQ和LFQ）的区别及常见的标准化方法。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方，请大家不吝赐教，您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

1、基于Maxquant软件处理的LabelFree蛋白质组学

首先，在使用Maxquant软件进行查库的时候，有两个参数值得大家关注：LFQ和iBAQ。
当我们在进行搜库时，如果两个参数都选择，将会在结果文件中有三个定量结果：Intensity，IBAQ和LFQ。
接下来，我们来详细解释一下这三个定量结果的区别：文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-445044.html

Intensity：将Protein Group中的所有Unique和Razor peptides的信号强度求和，作为最原始的强度值
iBAQ：基于 Intensity 的强度值，除以该蛋白的理论肽段数目，主要用于同一样本内，不同蛋白的相互比较
LFQ：基于 Intensity 的强度值，在不同样本间执行矫正操作，达到降低样本预处理，仪器分析等操作造成的样本间的差异，主要用于同一蛋白，不同样本间的表达差异。比如，不同处理方法间，同一蛋白的表达量变化

2、数据的标准化方法

Mean normalization
$norm(x_i)=\frac{x_i}{mean(x)}$
Median normalization
$norm(x_i) = \frac{x_i}{median(x)}$

到了这里，关于蛋白质组学两个定量方法（iBAQ和LFQ）的区别及常见的标准化方法的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容，请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章，希望大家以后多多支持TOY模板网！

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