MPI(Message-Passing Interface),并不是一种新的语言,而是消息传递接口,它定义了一个可以被C、C++和Fortran程序调用的函数库[1]。我们可以用MPI来进行进程间的通信,以消息传递的方式来对分布式内存系统进行编程。通过安装MPICH构建MPI编程环境,从而进行并行程序的开发。MPICH是MPI(Message-Passing Interface)的一个应用实现,支持最新的MPI-2接口标准,是用于并行运算的工具。
1.安装方案一(apt自动安装)
直接运行利用apt安装,执行下面的命令,按照提示操作即可,但是我安装后使用还是有问题。
apt安装命令:
apt-get install mpich
如果需要卸载:
sudo apt-get --purge remove mpich
安装之后可以利用第三部分提供的代码进行测试。
2.安装方案二(利用源码安装)
利用源码安装。
1.确保已经安装了如下软件
gcc --version
g++ --version
cmake --version
gfortran --version
如果没有直接sudo apt-get install xxx安装即可。
如果gfortran安装有问题,可以参考下面的:
sudo apt-get install gfortran
# 如果没有源则按下面更新下,再次安装
# sudo apt-get update
如果上面的命令,无法安装gfortran,则需要,显示:
gfortran : 依赖: gfortran-7 (>= 7.3.0-12~) 但是它将不会被安装 E: 无法修正错误,因为您要求某些软件包保持现状,就是它们破坏了软件包间的依赖关系,
gfortran : 依赖: gfortran-7 (>= 7.3.0-12~) 但是它将不会被安装
E: 无法修正错误,因为您要求某些软件包保持现状,就是它们破坏了软件包间的依赖关系
这表示有冲突了,所以可以采取如下命令安装,aptitude会提供一套解决冲突的方案,你可以根据提示选择合适方案安装,如果aptitude没有安装的,那么可以按照下面的安装即可:
sudo apt install aptitude
sudo aptitude install gfortran
2.下载源码
命令行下载
wget https://www.mpich.org/static/downloads/3.0/mpich-3.0.tar.gz
# 如果一次下载失败,可以继续执行下面的命令,进行断点续传:
wget -c https://www.mpich.org/static/downloads/3.0/mpich-3.0.tar.gz
手动下载tar.gz
官网:https://www.mpich.org/downloads/
3.解压
sudo tar -zxvf mpich-3.0.tar.gz
4.配置安装路径
下载的压缩包包含的是源码以及编译顺序文件,在linux中需要指定编译程可执行文件的库的位置,即是安装位置(也有安装包会自动指定位置,这些信息在Makefile之类的文件应该有写),后序在环境中配置即是要使用到安装的软件的库路径。(是库路径,不一定是编译结果.o文件的路径,实际编译的文件的路径大多在解压包的build文件夹下。)
解压完后, 进入解压后的文件夹,进行配置(我的配置安装位置为 /home/mpi/mpich3(提前准备好)。如果没有root权限,可以选择用户目录/home/XXX/mpich3)(这个安装路径随自己选的),将下面命令后面的prefix改成自己想设置的路径后,运行命令即可。
#这里指定安装的路径在这个文件夹中
sudo ./configure -prefix=/home/yangsc/mpich3
如果出现以下错误
configure: error: No Fortran 77 compiler found. If you don't need to build any Fortran progr
可能就是没有安装gfortran.安装方法看上面的方案二中的第一步。
5.编译和安装
配置完成后,执行编译和安装工作
sudo make
sudo make install
6.添加环境变量
在~/.bashrc 文件的最后添加几个环境变量,使运行时能够自动找到外部库环境;
export MPI_ROOT=/home/yangsc/mpich3
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
export MANPATH=$MPI_ROOT/man:$MANPATH
3.测试
随便找个地方新建一个测试文件,mpi_hello.cpp,代码如下:
#include <iostream>
#include <string.h>
#include <mpi.h>
using namespace std;
const int max_string = 100;
int main ()
{
int comm_sz=0;
int my_rank=0;
char greeting[max_string];
MPI_Init(NULL,NULL);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&my_rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&comm_sz);
if(my_rank!=0){
sprintf(greeting,"Greetings from process %d of %d!",my_rank,comm_sz);
MPI_Send(greeting,strlen(greeting),MPI_CHAR,0,0,MPI_COMM_WORLD);
}
else{
cout<<"Greetings from process "<<my_rank<<" of "<<comm_sz<<"!"<<endl;
for(int i=1;i<comm_sz;i++){
MPI_Recv(greeting,max_string,MPI_CHAR,i,0,MPI_COMM_WORLD,MPI_STATUS_IGNORE);
cout<<greeting<<endl;
}
}
MPI_Finalize ();
return 0;
}
然后重新打开terminal,进行编译
mpicxx -g -Wall -o mpi_hello.o mpi_hello.cpp
注意: 如果用root身份运行,会提示不能直接运行,他会提示你要么添加参数,要么换个非root用户身份运行,推荐换个身份运行;此外如果配置上了上面的环境变量依然报错,可以关闭终端,重新打开一个终端运行。
其中:
mpicc 是编译C程序的
mpicxx 是编译C++程序的
-g 允许使用调试器
-Wall 显示警告(W大写)
-o outfile.o 编译出可执行的文件,文件名为outfile.o
-02 告诉编译器对代码进行优化
编译完成后,开始运行,可由-n后面的数字来调节创建进程数。
mpirun -n 4 ./mpi_hello.o
最后得到的结果为,有可能顺序不一样
Greetings from process 0 of 4!
Greetings from process 1 of 4!
Greetings from process 2 of 4!
Greetings from process 3 of 4!
至此,MPI的安装和测试全部完成。文章来源:https://www.toymoban.com/news/detail-446903.html
参考文献
[1] [美]Peter S.Pacheco.并行程序设计导论[M].邓倩妮等译注.北京:机械工业出版社,2012.8
[2] 百度百科, https://baike.baidu.com/item/MPICH/7488372?fr=aladdin
[3]Ubuntu18.10安装MPICH, https://www.jianshu.com/p/74d30935f277
[4]我的并行计算之路(一)Ubuntu 16.04下的MPI安装, https://blog.csdn.net/qq_30239975/article/details/77703321
主要参考链接:https://blog.csdn.net/qq_39451578/article/details/107938560文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-446903.html
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