玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

数据集介绍

Lung-PET-CT-Dx是一个公开肺癌目标检测数据集,该公共数据集源自 The Cancer Imaging Archive(TCIA)。TCIA是肿瘤研究方面的著名的医学影像公开数据库。大部分数据以 DICOM 格式存储,所有数据都经过去隐私处理。

该数据集由肺癌受试者的 CT 和 PET-CT DICOM 图像组成,带有 XML 注释文件(xml文件中用边界框标识了肿瘤位置和分类)。 这些PET/CT影像是从肺癌患者中回顾性获得的,患者均经肺活检确诊 。 根据组织病理学诊断对受试者进行分组,分为4类,“A”诊断为腺癌,“B”为小细胞癌,“E”为大细胞癌,“G”为鳞状细胞癌。

玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

数据集中共有355例次的影像记录,记录了患者的CT或PET-CT的影像资料,CT图像的分辨率是512×512。

下面两张图是下载好的数据集的CT图像部分。其主要是胸部PET-CT的图像,包括了 灰度的CT图像 和 带代谢摄取增高显像的CT图像。

玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

如何从TCIA下载数据集

(该小节可能需要特殊方式访问目标网站)

Lung-PET-CT-Dx数据集源自TCIA。TCIA是肿瘤研究方向的医学影像公开数据库。
我们可以在官网的 Access The Data → Browse Data Collection 浏览所有数据集。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

我们可以在Filter table处,输入“lung”等关键词筛选我们需要的数据集。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集


我们输入Lung-PET-CT-Dx进入我们的目标数据集页面。
找到下面的Data Access界面。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集
Images 为我们需要下载的影像资料。
Annotation Files是目标检测的标注数据(即XML注释文件,标注了肿瘤位置和分类)。
Clinical Data是患者相关的临床资料。
下面两个可以直接下载。


第一个Image,我们点击Download,会发现下载了一个tcia文件(Lung-PET-CT-Dx-NBIA-Manifest-122220.tcia)。
这是一个下载列表文件,需要使用网站提供的 NBIA Data Retriever 软件进行下载。

单击下面的NBIA Data Retriever,在新页面中选择 Downloading the NBIA Data Retriever,如果你是Windows系统,点击 Windows即可下载安装文件。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

下载后打开安装文件完成安装。
安装完后直接打开软件会提示需要tcia文件。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集


我们把前面下载的 Lung-PET-CT-Dx-NBIA-Manifest-122220.tcia 文件直接和 NBIA Data Retriever 的快捷方式放在一起。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

然后打开 tcia文件 即可,单击Agree,即可看到下载页面了。
单击 Start,开始下载数据集(准备好半天的时间下载)。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集

下载数据集的一部分

如果觉得数据集太大了,我只想要其中的一小部分该怎么做呢?
我们回到数据集页面,在刚才的 Images 处单击 Search 按钮。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集


我们可以在这里逐条浏览数据集中的各条数据,甚至可以浏览每一张的CT图片。
对于我们想要的条目,可以单击购物车 Cart 按钮。
玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集


挑完后,单击Cart进入购物车页面,单击Download即可下载对应的 tcia文件。
我们把这个文件和 NBIA Data Retriever 的快捷方式放在一起,即可打开下载我们想要的数据了。

玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-456397.html

到了这里,关于玩转肺癌目标检测数据集Lung-PET-CT-Dx ——①从TCIA获取影像数据集的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处: 如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请点击违法举报进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

领支付宝红包 赞助服务器费用

相关文章

  • 快速玩转Yolov5目标检测—没有好的显卡也能玩(二)

            上篇  快速玩转Yolov5目标检测—没有好的显卡也能玩(一) 已经将YoloV5在我的笔记本电脑上快速跑起来了,因为电脑显卡一般,所以运行的CPU版本,从推理结果来看,耗时还是蛮高的,如下图,平均每帧0.45秒左右: 理论上这已经能满足很多场景下的需求了,比如明

    2024年02月05日
    浏览(37)
  • 【玩转Jetson TX2 NX】(七)TX2 NX YoLoV4环境搭建+板载摄像头实时目标检测(详细教程+错误解决)

    直接下载,然后解压,最后移动到Jetson TX2 NX,如图所示,darknet下载链接: https://github.com/AlexeyAB/darknet 将解压的文件复制到Jetson TX2 NX,如图所示: 下载yolov4.weights权重文件,如图所示: 将权重文件 yolov4.weights 拷贝至 darknet 目录下,如图所示: 依次输入命令,修改Makefile 如图

    2024年02月10日
    浏览(31)
  • 目标检测数据集:红外图像弱小飞机目标检测数据集

    ✨✨✨✨✨✨目标检测数据集✨✨✨✨✨✨ 本专栏提供各种场景的数据集,主要聚焦: 工业缺陷检测数据集、小目标数据集、遥感数据集、红外小目标数据集 ,该专栏的数据集会在多个专栏进行验证,在多个数据集进行验证mAP涨点明显, 尤其是小目标、遮挡物精度提升明显

    2024年02月08日
    浏览(26)
  • [数据集][目标检测]垃圾目标检测数据集VOC格式14963张44类别

    数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):14963 标注数量(xml文件个数):14963 标注类别数:44 标注类别名称:[\\\"toiletries\\\",\\\"plastic utensils\\\",\\\"seasoning bottles\\\",\\\"leftovers\\\",\\\"chopsticks\\\",\\\"ceramic utensils\\\",\\\"pots\\\",\\\"metal utensils\\\",\\\"cutting boards\\\",\\\"ol

    2024年02月11日
    浏览(31)
  • 03- 目标检测数据集和标注工具介绍 (目标检测)

    要点: 常用数据集和标注工具 标注工具 PPOCRLabel github地址:paddleocrlabel 参考文档:目标检测简介 - 知乎 1. PASCAL VOC VOC数据集 是目标检测经常用的一个数据集,自2005年起每年举办一次比赛,最开始只有4类,到2007年扩充为 20个类 ,共有两个常用的版本: 2007和2012 。学术界常

    2024年02月07日
    浏览(28)
  • [数据集][目标检测]道路坑洼目标检测数据集VOC格式1510张2类别

    数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割路径的txt文件和yolo格式的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):1510 标注数量(xml文件个数):1510 标注类别数:2 标注类别名称:[\\\"keng\\\",\\\"jingai\\\"] 每个类别标注的框数: keng count = 3166 jingai count = 442 使用标注工具:labelI

    2024年02月12日
    浏览(26)
  • [数据集][目标检测]城市道路井盖破损丢失目标检测1377张

    数据集制作单位:未来自主研究中心(FIRC) 数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割路径的txt文件和yolo格式的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):1377 标注数量(xml文件个数):1377 标注类别数:4 标注类别名称:[\\\"jg\\\",\\\"jg_ps\\\",\\\"jg_ds\\\",\\\"jg_nd\\\"] 每个类别标注的框数:

    2024年02月15日
    浏览(33)
  • [数据集][目标检测]钢材表面缺陷目标检测数据集VOC格式2279张10类别

    数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割路径的txt文件和yolo格式的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):2279 标注数量(xml文件个数):2279 标注类别数:10 标注类别名称:[\\\"yueyawan\\\",\\\"siban\\\",\\\"hanfeng\\\",\\\"chongkong\\\",\\\"shuiban\\\",\\\"yahen\\\",\\\"youban\\\",\\\"yaozhe\\\",\\\"zhehen\\\",\\\"yiwu\\\"] 每个类别标注的

    2024年02月12日
    浏览(34)
  • [数据集][目标检测]PCB板缺陷目标检测数据集VOC格式693张6类别

    数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割路径的txt文件和yolo格式的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):693 标注数量(xml文件个数):693 标注类别数:6 标注类别名称:[\\\"missing_hole\\\",\\\"spurious_copper\\\",\\\"spur\\\",\\\"mouse_bite\\\",\\\"open_circuit\\\",\\\"short\\\"] 每个类别标注的框数: missin

    2024年02月12日
    浏览(26)

觉得文章有用就打赏一下文章作者

支付宝扫一扫打赏

博客赞助

微信扫一扫打赏

请作者喝杯咖啡吧~博客赞助

支付宝扫一扫领取红包,优惠每天领

二维码1

领取红包

二维码2

领红包