在linux服务器中对R语言中for循环设置多核运行

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了在linux服务器中对R语言中for循环设置多核运行。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

1 问题

在R中构建了for循环,由于循环过多,运行速度过慢,且不同循环之间是并行关系,拟通过多核运行可以解决此问题。

2 代码设置

2.1 shell脚本中的设置

b.sh

export OPENBLAS_NUM_THREADS=8

Rscript ./..._1.R \

2.2 R代码中的设置

library(parallel)
fun <- function(i){
  a  <- coordinate_file[i,4]
  }

detectCores(logical = F)  
mc <- getOption("mc.cores", 70)  # 设置核数,根据需要设置70
mclapply(1:37987, fun, mc.cores = mc)
stopCluster(mc)

2.3 shell脚本运行

应以nohup运行,防止网络断掉

nohup sh b.sh >out 2>err &

在linux服务器中对R语言中for循环设置多核运行

参考

多核运行:
1、https://www.cnblogs.com/ywliao/articles/6681781.html/
2、https://blog.csdn.net/u012252959/article/details/116201536

OPENBLAS_NUM_THREAD
1、https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/106115577
2、https://cloud.tencent.com/developer/article/1880367

kill nohup进程
1、https://blog.csdn.net/geol200709/article/details/91539025文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-472697.html

到了这里,关于在linux服务器中对R语言中for循环设置多核运行的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处: 如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请点击违法举报进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

领支付宝红包 赞助服务器费用

相关文章

  • Linux系统管理、服务器设置、安全、云数据中心

    前些天发现了一个巨牛的人工智能学习网站,通俗易懂,风趣幽默,忍不住分享一下给大家 :https://www.captainbed.cn/z chatgpt体验地址 本文以服务器最常用的CentOS为例 解释每个字符的含义如下: [:表示命令行提示符的开始。 root:表示当前用户为root用户。 @:表示分隔符,用于

    2024年02月04日
    浏览(56)
  • linux服务器ubuntu定时任务cron设置每秒执行

    后端的同学经常会遇到在服务器做一些定时脚本处理,比如定时清理日志,定时请求某个接口做特殊的业务处理,大多数linux版本都会带cron服务,以ubuntu服务器做个示例。 cron 是一个在 Unix-like 操作系统中用于定时执行任务的工具。它是 “Chronos”(希腊语,意为时间)的缩写

    2024年02月02日
    浏览(59)
  • (Windows )本地连接远程服务器(Linux),免密码登录设置

    在使用VScode连接远程服务器时,每次打开都要输入密码,以及使用ssh登录或其它方法登录,都要本地输入密码,这大大降低了使用感受,下面总结了免密码登录的方法,用起来巴适得很,起飞。 本地必须在PowerShell终端操控,如下: 打开终端后在终端输入以下命令: 回车再回

    2024年02月11日
    浏览(56)
  • linux服务器 tcp高并发压测需要设置项

    linux服务器部署了一个tcp服务,需要进行并发压力测试  看看服务器能支持多少个tcp长连接   预计会有50w个连接 需要设置linux 不然是无法支持这么多连接的   如果达到这个值是无法建立新连接的  报错信息一般为  too many open files   1 ,  fs.file-max linux系统能打开的文件句柄

    2024年04月10日
    浏览(43)
  • 阿里云服务器linux部署nginx-(阿里云服务器端口打不开解决方法-防火墙和安全组设置)

    ( 1 ) nginx官网 下载最新版本安装包: nginx: download (2)或者直接wget命令下载 如果有报错:   验证nginx是否启动 # 查看端口号被哪个进程占用 netstat -ntlp | grep 80 # 查看防火墙开放端口 firewall-cmd --zone=public --list-ports # 若防火墙关闭,检查防火墙状态,开启防火墙 systemctl sta

    2024年04月09日
    浏览(55)
  • 【Linux服务器】 .bashrc设置永久环境变量后不起作用的问题

            在使用vi打开.bashrc文件以后设置环境变量         然而发现设置了以后不起作用。这时候可以在终端界面使用export命令查看当前所有的PATH变量,我的情况是只出现了一条,别的都没有,这就说明在配置环境变量的过程中有一条配置语句将其他的PATH变量全部覆

    2024年02月02日
    浏览(50)
  • Linux socket 搭建TCP服务器(C语言)

    ​ 在标题之前,先提几个问题,方便下次查看理解。 什么是TCP TCP服务器需要用到哪些函数 如何简单的搭建一个TCP服务器 ​ TCP 是一种传输层协议,可以提供可靠的数据传输服务。它是面向连接的,具有可靠性、流量控制、拥塞控制以及双工通信的特点。 1. socket ​ socket 作

    2024年04月17日
    浏览(40)
  • Linux系统编程,使用C语言实现简单的FTP(服务器/客户端)

    前言 跟着上官社长 陈哥花了一个月的时间终于把Linux系统编程学的差不多了,这一个月真的是头疼啊,各种bug,调的真心心累,不过好在问题都解决掉了,在此也感谢一下答疑老师,给我提供了很多的思路,本文章是对前段时间学习Linux,做一个小小的总结,才疏学浅,只学

    2024年02月12日
    浏览(73)
  • 安卓开发后台应用周期循环获取位置信息上报服务器

    最近有需求,在APP启动后,退到后台,还要能实现周期获取位置信息上报服务器,研究了一下实现方案。 一、APP退到后台后网络请求实现 APP退到后台后,实现周期循环发送网络请求。目前尝试了两种方案是OK,如下: (1)AlarmManager + 前台服务 +广播的方案,可以正常实现,

    2024年02月16日
    浏览(41)

觉得文章有用就打赏一下文章作者

支付宝扫一扫打赏

博客赞助

微信扫一扫打赏

请作者喝杯咖啡吧~博客赞助

支付宝扫一扫领取红包,优惠每天领

二维码1

领取红包

二维码2

领红包