基于R语言的物种气候生态位动态量化与分布特征模拟

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了基于R语言的物种气候生态位动态量化与分布特征模拟。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

目录

专题一 引言

专题二 数据获取与处理方法

专题三 组合物种分布模型(Ensemble Species Distribution Model)的原理与使用

专题四 拓展研究

专题五 结果分析与论文写作

专题六 案例分析

专题七 总结和展望


利用R语言进行物种气候生态位动态量化与分布特征模拟,不仅可以量化描述物种对环境的需求和适应性,预测物种的潜在生态位和分布,还可以模拟物种分布的动态变化,捕捉生物种群生态位的时空异质性。这种技术为我们提供了一种更加精确、系统的工具,有助于我们更好地理解生物种群分布的生态驱动机制,为制定和实施生物保护策略提供科学依据。

R语言是一种广泛用于统计分析和图形表示的编程语言,强大之处在于可以进行多元数据统计分析,以及丰富的生态环境数据分析的方法,在生态学领域得到广泛应用。本次教程将通过R语言多个程序包与GIS融合应用,提升物种气候生态位动态量化与分布特征模拟的研究方法和技能。

【目标】:
1、理解物种气候生态位的概念和作用;
2、掌握R语言在物种气候生态位动态量化与分布特征模拟中的基本操作;
3、学会利用R语言进行物种气候生态位动态量化与分布特征模拟的实际案例分析;
4、培养对物种气候生态位动态量化与分布特征模拟的研究方法和技能。

专题一 引言

1) 物种气候生态位理论基础
2) 物种分布特征与物种分布模型的基本原理
3) R语言基础 (R语言环境设置和基本操作、数据导入、处理和可视化)

专题二 数据获取与处理方法

1) 数据获取途径与方法
掌握模型所需数据类型,了解常用数据库与数据获取方法

2) 数据清洗与变量选择
掌握模型数据输入格式与数据选择标准,学会用多种方式实现数据清洗与变量选择

专题三 组合物种分布模型(Ensemble Species Distribution Model)的原理与使用

1)组合物种分布模型算法原理与参数组成
常用算法:通用加法模型(GAM)、广义线性模型(GLM)、多元自适应回归(MARS)、分类树分析(CTA)、广义增强模型(GBM)、最大熵(Maxent)、人工神经网络(ANN)、随机森林(RF)、支持向量机(SVM)
章节目标:掌握不同算法的原理与参数设置方法

2)物种分布特征模拟
分别基于单一算法与组合算法进行物种分布特征模拟,并读模拟结果。
章节目标:可独立使用R语言完成物种分布特征模拟。

3)效果评价
评价指标:接收操作特征 (ROC) 曲线 (AUC) 下的面积、Cohen 的 Kappa 系数、遗漏率、灵敏度(真阳性率)和特异性(真阴性率)
章节目标:了解不同评价指标计算原理。

4)物种分布特征预测
章节内容与目标:设置不同情景,实现物种适生区预测

专题四 拓展研究

1)物种气候生态位动态量化
以入侵物种互花米草为例,分析量化物种在原产地与入侵地之间的生态位的差异性。主要步骤:二维网格物种地理空间和环境空间的定义、应用核平滑计算二维环境空间的气候密度、通过随机检验方法对原产地和入侵区气候生态位的相似性进行统计检验,量化入侵区相比原产地的气候生态位动态等。

2)物种适生区质心转移
基于物种在不同时空尺度的模拟结果,统计并分析物种适生区变化情况,并在空间上实现质心转移的可视化分析。

专题五 结果分析与论文写作

1)不同算法结果解读、比较
2)论文制图与写作技巧

专题六 案例分析

1)基于单个物种分布模型的案例
2)基于组合物种分布模型的案例

专题七 总结和展望

1)物种分布模型的局限性和未来发展方向
2)学习资源和进一步学习的建议

BIOMOD2模型、MaxEnt模型物种分布模拟,生物多样性生境模拟,论文写作_WangYan2022的博客-CSDN博客BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种与其环境之间的关系,试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位。https://blog.csdn.net/WangYan2022/article/details/127957575?spm=1001.2014.3001.5502文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-477877.html

到了这里,关于基于R语言的物种气候生态位动态量化与分布特征模拟的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处: 如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请点击违法举报进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

领支付宝红包 赞助服务器费用

相关文章

  • 基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟

     随着生物多样性全球大会的举办,不论是管理机构及科研单位、高校都在积极准备,根据国家林草局最新工作指示,我国将积极整合、优化自然保护地,加快推进国家公园体制试点,构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标

    2024年04月08日
    浏览(37)
  • 生态系统NPP及碳源、碳汇模拟(土地利用变化、未来气候变化、空间动态模拟)

    由于全球变暖、大气中温室气体浓度逐年增加等问题的出现,“双碳”行动特别是碳中和已经在世界范围形成广泛影响。碳中和可以从碳排放(碳源)和碳固定(碳汇)这两个侧面来理解。陆地生态系统在全球碳循环过程中有着重要作用,准确地评估陆地生态系统碳汇及碳源

    2024年02月07日
    浏览(45)
  • 生态系统NPP及碳源、碳汇模拟——土地利用变化、未来气候变化、空间动态模拟

    由于全球变暖、大气中温室气体浓度逐年增加等问题的出现,“双碳”行动特别是碳中和已经在世界范围形成广泛影响。碳中和可以从碳排放(碳源)和碳固定(碳汇)这两个侧面来理解。陆地生态系统在全球碳循环过程中有着重要作用,准确地评估陆地生态系统碳汇及碳源

    2024年02月08日
    浏览(41)
  • CMIP6数据处理及在气候变化、水文、生态等领域中的实践技术应用

    查看原文 最新CMIP6数据处理及在气候变化、水文、生态等领域中的实践技术应用 气候变化对农业、生态系统、社会经济以及人类的生存与发展具有深远影响,是当前全球关注的核心议题之一。IPCC(Intergovernmental Panel on Climate Change,政府间气候变化专门委员会)的第六次评估报

    2024年02月15日
    浏览(43)
  • LSTM Word 语言模型上的(实验)动态量化

    量化涉及将模型的权重和激活从 float 转换为 int,这可能会导致模型尺寸更小,推断速度更快,而对准确性的影响很小。 在本教程中,我们将最简单的量化形式-动态量化应用于基于 LSTM 的下一个单词预测模型,紧紧遵循 PyTorch 示例中的单词语言模型 。 在这里,我们根据词语

    2024年02月10日
    浏览(37)
  • Asynq: 基于Redis实现的Go生态分布式任务队列和异步处理库

    Asynq [1] 是一个Go实现的分布式任务队列和异步处理库,基于redis,类似Ruby的 sidekiq [2] 和Python的 celery [3] 。Go生态类似的还有 machinery [4] 和goworker 同时提供一个WebUI asynqmon [5] ,可以源码形式安装或使用Docker image, 还可以和Prometheus集成 docker run --rm --name asynqmon -p 8080:8080 hibiken/as

    2024年02月14日
    浏览(43)
  • BIOMOD2模型、MaxEnt模型物种分布模拟,生物多样性生境模拟,论文写作

    ①基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟实践技术应用 针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。 BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种

    2024年02月07日
    浏览(61)
  • R语言ggplot2 | R语言绘制物种组成面积图(三)

       利用R语言绘制物种组成图。本文以堆叠面积图的方式与大家分享。 面积图又叫区域图。它是在折线图的基础之上形成的, 它将折线图中折线与自变量坐标轴之间的区域使用颜色或者纹理填充,这样一个填充区域我们叫面积。颜色的填充可以更好地突出趋势信息(比如时

    2024年02月13日
    浏览(39)
  • 基于ArcGIS Pro、R、INVEST等多技术融合下生态系统服务权衡与协同动态分析

    详情点击链接:基于ArcGIS Pro、R、INVEST等多技术融合下生态系统服务权衡与协同动态分析 生态系统服务是指生态系统所形成的用于维持人类赖以生存和发展的自然环境条件与效用,是人类直接或间接从生态系统中得到的各种惠益。生态系统服务单一化会导致各项服务能力持续

    2024年02月07日
    浏览(64)
  • 扫地僧Backtrader量化回测与交易闭环生态系列教程

    backtrader是著名的开源量化框架,作者叫Daniel Rodriguez,就是下图这位老兄。 这个作者是德国人,工作在德国慕尼黑,编程水平极高,比国内一些非专业程序员编写的回测平台代码质量高太多。backtrader框架编码简洁优雅,用户编写回测策略所需代码量极少。 遗憾的是这位德国

    2024年02月11日
    浏览(40)

觉得文章有用就打赏一下文章作者

支付宝扫一扫打赏

博客赞助

微信扫一扫打赏

请作者喝杯咖啡吧~博客赞助

支付宝扫一扫领取红包,优惠每天领

二维码1

领取红包

二维码2

领红包