在国内从官网上下载安装包会比较慢,下载最新版容易,过往版本不易寻找。生信软件一般建议使用过往的稳定版本,尤其是公司集群的系统版本低,很容易版本不匹配。推荐从清华大学的源下载。
下载
## anaconda的官网地址
https://www.anaconda.com/products/individual
## 清华源anaconda、 miniconda 的过往版本
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
## 选择适合自己的版本后,用wget下载
>> wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh
## 如果网站证书已过期,需要增加参数--no-check-certificate下载
>>wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate安装
按照如下命令执行,安装软件。
chmod 755 Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh
不能像其他软件安装一样,一路yes,有几个地方需要注意。
- 接受软件安装条款
2. 指定软件安装目录
指定在Software目录下安装该软件,会自动生成Software/Miniconda文件夹,软件内容在此目录下。注意,安装前不能存在"Miniconda"文件夹,否则会报错’directory xxx already exists’,切记。
3.拒绝把conda加入环境变量
不将conda加入.bashrc 不会影响 后续的使用,后续决定权在你且问题可控。如果每个人都默认加入,每次登陆时会默认激活conda的base环境,这会导致集群登录很卡。如果之前有安装conda,且将大量的软件直接安装在conda的base环境 或者 账号是公用账号,可能会把你 原来设置好的环境改变,影响部分软件、脚本的正常运行,得不偿失。
启动conda
激活conda,进入自带的base基础环
## 激活conda,进入base环境 source activate
## 如果无法执行,可以考虑修改Miniconda/bin/activate的权限为755
## 如果还不能激活 source ~/.bashrc 后在conda activate env_name
## 查看conda的安装路径
which conda
## 推出base环境
conda deactivate
创建虚拟环境及安装对应应用包
conda create -n your_env_name python=x.x 例:conda create --name py27 python=2.7
进入环境: conda activate py27
安装包:pip install 包名 例: pip install pymysql文章来源:https://www.toymoban.com/news/detail-480292.html
注意安装mysqlDB时无法安装,用 conda install mysql-python进行安装即可文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-480292.html
到了这里,关于Liunx 安装 Miniconda与Python环境的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!