R | 可视化 | 热图(Heatmap)

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1 基础绘制

R绘制热图时,数据需要输入一个矩阵,可以用as.matrix()把它转换成矩阵。这里利用R自带的数据集绘制热图。

> # 数据
> data <- as.matrix(mtcars)
> 
> # 绘制热图
> heatmap(data)

OUTPUT:

R | 可视化 | 热图(Heatmap)

热图的每一列是一个变量,每一行是一个观察值,每个方块是一个值,越接近黄色越高。

t(data)可以对矩阵进行转置,交换热图的X和Y轴。

2 正态化

# 正态化
> heatmap(data, scale="column")

OUTPUT:

R | 可视化 | 热图(Heatmap)

 3 取消树状图与排序

heatmap()使用聚类算法对变量和观测值文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-509682.html

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