VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建

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【Talk】VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建

报告主页:http://valser.org/article-359-1.html

20200415 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建

PPT:Shanshan Wang slides | Bihan Wen slides

谷歌学术:

  • 王珊珊 Shanshan Wang | siat
  • 文碧汉 | ntu

Deep learning for MR imaging and analysis - Shanshan Wang

可以参考前面链接中的ppt,这里不重点讲,我们主要关注文碧汉老师的talk。

Machine Learning for CS MRI: From Model-Based Methods to Deep Learning - Bihan Wen

重建问题简介

计算机视觉准确来说是图像理解,成像/重建的本质是感知,从低质量观测恢复高质量图像。

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MRI成像过程可以看做下面的公式:

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理想情况下k-space是连续的,但是由于信息的采集都是的数字信号,因此采集到的都是离散化的数据,因此可以说采集到的k-空间的全采样图像都是真实情况下的欠采样。

但是我们要讨论的情况是在全采样情况下的欠采样,也就是对全采样的图像我们只采样部分区域,如下图:

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但是直接求解这个逆过程是一个ill-posed 问题。在十年前,压缩感知作为一个比较好的方法在重建领域大放异彩。

压缩感知介绍

经典压缩感知公式如下

  • 有约束优化问题(Transform domain sparsity):利用MR成像的关系式 F u x = y F_ux=y Fux=y,我们设计一个有约束的优化问题。目标在固定的Transform(变换)下的最优的sparsity,找到使得sparsity最优的 x x x

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  • 无约束优化问题:sparsity作为正则项VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

稀疏性

①为什么sparsity比较重要?

image model的作用如下,即提供判断是否为我们想要的图像的依据。VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

②信号的稀疏性定义

定义:一个dense的信号在transform domain是稀疏的

举例:一个一维信号是稀疏的 ⇔ \Leftrightarrow 大多数相关系数为0

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特点:自然信号大都是满足sparsity属性的,例如自然图像的离散余弦变换VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

而噪声的离散余弦变换仍为噪声:

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磁共振重建领域的压缩感知方法发展如下:

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Model-based method: Transform learning for better sparsity

基本概念

在压缩感知中,我们给定了一个变换 Ψ \Psi Ψ(如DCT、小波等等),求得这个变换下最稀疏的 x x x。如下式:

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但是我们希望去学习这个变换,使得稀疏化更好,如下图:

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1.Transform learning Method 1: Sparsifying Transform Learning(STL)

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符号解释:

W \mathbf{W} W: 要学习的变换矩阵; b i \mathbf{b}_i bi: patch对应的sparse code

P i \mathbf{P}_i Pi: 图像中的第 i i i个patch;

λ 2 ∥ W ∥ F 2 − λ l o g ( d e t W ) \frac \lambda 2 \Vert \mathbf W\Vert^2_F - \lambda log(det \mathbf W) 2λWF2λlog(detW): 保证了 W , b \mathbf W,\mathbf b W,b不会变成一个trivial的解:为0,保证让 λ 2 ∥ W ∥ F 2 \frac \lambda 2 \Vert \mathbf W\Vert^2_F 2λWF2其尽量趋近于1

该方法的优缺点:

① 有闭式解

2.Unitary Transform Learning (UT)

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算法的具体实现过程:VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

3. Learning a UNIon of Transforms (UNITE)

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图像比较复杂的情况下,一个transformer是不够的。

4.Flipping and Rotation Invariant Sparsifying Transform (FRIST)

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5. Sparsifying TRansfOrm Learning and Low-Rankness (STROLLR)

有的时候不光使用sparsity,也可以构建Low-rank,将二者结合在一起约束。

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总结

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讨论

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注:不同的model在不同的MRI中有不同的效果,需要选择更适合的方法,达到最好的效果。VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

Deep Learning

一些主流模型

model的发展,即model灵活性的上升,模型具有更好的适应性:VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理

下面我们主要关注两种方向:①unroll network(主流),将迭代过程变为多个network,如下图:

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②另一种想法就是设计多层的transform:

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一些结果:

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此外,自监督的方式也有一定的优势:我们希望模型不只是拘泥于数据集,而要一定程度上focus在图像本身,根据图像本身的一些全局和局部信息进行重建。

深度学习模型和传统模型的对比

VALSE 20200415 | 机器学习 vs 压缩感知:核磁共振成像与重建,磁共振重建,机器学习,人工智能,图像处理文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-541119.html

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