Ubuntu服务器安装配置slurm (Ubuntu 22.04 LTS)

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了Ubuntu服务器安装配置slurm (Ubuntu 22.04 LTS)。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

Ubuntu服务器安装配置slurm (Ubuntu 22.04 LTS)

1. slurm简介

Slurm 全称 Simple Linux Utility for Resource Management。通常被用于大型Linux服务器 (超算) 上,作为任务管理系统。本文详细讲述如何在 Ubuntu 22.04 LTS 上安装slurm,并进行简单的配置。

其实网上相关的教程已经非常多,但在旧版本的Ubuntu上安装slurm时,通常需要安装一个名为slurm-llnl的软件包。但Ubuntu 22.04 LTS 的软件源不包含slurm-llnl,强行安装就会报出如下的错误:

$ sudo apt install slurm-llnl
Reading package lists... Done
Building dependency tree... Done
Reading state information... Done
E: Unable to locate package slurm-llnl

2. slurm的安装步骤

Step 1. 安装依赖的软件包

  1. slurmd: 完成计算节点的任务(启动任务、监控任务、分层通信)
  2. slurmctld: 完成管理节点的任务(故障切换、资源监控、队列管理、作业调度)
$ sudo apt update
$ sudo apt install slurm-wlm
# `slurmd`: compute node daemon
$ sudo apt install slrumd  (提示已安装)
# `slurmctld`: central management daemon
$ sudo apt install slurmctld  (提示已安装)

Step 2. 找到slurm-wlm-configurator.html文件,进入该目录下

# 输入以下命令,并
$ dpkg -L slurmctld | grep slurm-wlm-configurator.html
/usr/share/doc/slurmctld/slurm-wlm-configurator.html
$ cd /usr/share/doc/slurmctld
$ sudo chmod +r slurm-wlm-configurator.html

Step 3. 利用 web 生成配置文件

$ python3 -m http.server
Serving HTTP on 0.0.0.0 port 8000 (http://0.0.0.0:8000/) ...

打开浏览器,输入 http://:8000/,进入配置页面,点击进入 slurm-wlm-configurator.html 按照自己的需求填写设置。

Cluster Name:随意起名

Control Machines:控制节点的计算机名

Compute Machines:计算机名、ip地址、分区名和任务时间限制

cpus:虚拟机直接指定虚拟cpu数量

Sockets: 物理机不指定cpus,指定cpu插槽

CoresPerSocket: 物理机每个插槽有多少core

ThreadsPerCore: 物理机每个core有多少个线程,超线程的CPU此数字为2

slurmuser:指定为root用户

Process Tracking:选择 LinuxProc: Use parent process ID records, processes can escape from Slurm control

web 生成slurm.conf

填写完毕后,点击submit,将生成的内容拷贝进 /etc/slurm/slurm.conf (slurm 的配置文件)

# 创建
$ sudo touch /etc/slurm/slurm.conf
# 将网页生成的内容 copy 进来
$ sudo vim /etc/slurm/slurm.conf
# ctrl + v

Step 4. 手动创建slurm的输出文件目录

$ sudo mkdir /var/spool/slurmd
$ sudo mkdir /var/spool/slurmctld

Step 5. 启动 slurm 服务

# 启动 slurmd, 日志文件路径为 `/var/log/slurmd.log`
$ sudo systemctl start slurmd
# 启动 slurmctld, 日志文件路径为 `/var/log/slurmctld.log`
$ sudo systemctl start slurmctld

启动后无法正常使用 slurm 的话,先查看slurmd和slurmctld的状态,打开日志查看报错。

# 查看 slurmd 的状态
$ sudo systemctl status slurmd
# 查看 slurmctld 的状态
$ sudo systemctl status slurmctld

3. slurm.conf 中几个关键 column 的填写

C1. ClusterName

集群名,随便取

C2. SlurmctldHost

管理节点的主机名

# 获取主机名
$ hostname -s
mu01

C3. SlurmUser

最好 SlurmUser=root,权限最高,填写日志文件不会由于权限问题报错

C4. 管理节点和计算节点的配置(slurm.conf的最后三行)

此处以单节点集群举例(单个节点既作为管理节点,又作为计算节点)

EnforcePartLimits=ALL
NodeName=mu01 CPUs=36 State=UNKNOWN     # 本行可以通过 `slurmd -C` 获取
PartitionName=compute Nodes=mu01 Default=YES  MaxTime=INFINITE State=UP   # 创建一个名为compute的队列

slurmd -C 的输出:

$ slurmd -C
NodeName=mu01 CPUs=36 Boards=1 SocketsPerBoard=1 CoresPerSocket=10 ThreadsPerCore=2 RealMemory=63962

脚本内容111.sh

#!/bin/bash
#SBATCH -p debug
#SBATCH -J test
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 4
#SBATCH -o out.log
#SBATCH -e error.log

mpirun -np 4 vasp_std

作业提交命令:(在slurm安装配置完成,提交作业之前需要重启一次服务器)

sbatch -n 4 111.sh

sbatch 111.sh

作业队列:squeue

作业状态:sinfo

作业输出:tail -f out.log文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-731930.html

到了这里,关于Ubuntu服务器安装配置slurm (Ubuntu 22.04 LTS)的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

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