R语言 gwasglue 包安装

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了R语言 gwasglue 包安装。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

使用github安装包:devtools::install_github("mrcieu/gwasglue", force = TRUE) 失败

1.注意先

install.packages("devtools")

加载library("devtools") 才能用github安装。

这里,我使用的R版本是4.3.0,不知道哪里下载,直接用我在网盘里的(永久有效)

链接:https://pan.baidu.com/s/1WSY9rBHHXQPBidlVtctUkQ 
提取码:aaaa 
--来自百度网盘超级会员V4的分享

2.安装包出现错误, 无法打开https 链接

Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet,: 无法打开...

解决方法:更换镜像。 多换几个镜像试试,最后换其它镜像可以安装了。URL'https://api.github.com/repos/。。

 devtools::install_github("mrcieu/gwasglue", force = TRUE)
Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub:
  HTTP error 403.
  API rate limit exceeded for 175.29.122.76. (But here's the good news: Authenticated requests get a higher rate limit. Check out the documentation for more details.)
  Rate limit remaining: 0/60
  Rate limit reset at: 2022-8-21 11:33:21 UTC
  To increase your GitHub API rate limit
  - Use `usethis::create_github_token()` to create a Personal Access Token.
  - Use `usethis::edit_r_environ()` and add the token as `GITHUB_PAT`.

出现了API下载速率限制的问题,返回error 403,并要求使用github_token()取消api rate 的限制。这是因为github会扫描需要安装的依赖程序,如果数目超过他的api rate,github就会限制下载,解决办法是使用自己的token认证(相当于去github上认证一下,挂个号,然后给你安装)。

解决办法:制备github token

1. 在R或Rstiudio命令行输入  create_github_token(),浏览器自动跳转到github网站,登录或注册。

2. 首先命名token,可以随意写,有效期也可以随意选。勾选repo,goken用于下载github上的代码仓库。

R语言 gwasglue 包安装,r语言,开发语言

3. generate  token。 记得拷贝token密码,关闭网页后就查不到了。但可以再申请一次。

R语言 gwasglue 包安装,r语言,开发语言4.打开R 输入 

usethis::edit_r_environ()

 在弹出的R编辑器输入

GITHUB_TOKEN="ghp_8lNL……"(自己的密码)

R语言 gwasglue 包安装,r语言,开发语言

保存,关闭编辑器。 

5. 一定要关闭R软件,重新打开,不然环境变量加不进去。

重新打开后可以政策安装。

library("devtools")

devtools::install_github("mrcieu/gwasglue", force = TRUE)

这时候,可能还会报错,缺少"xxx"包forgwasglue

百度R “xxx”包,找到这个包的压缩文件,直接下载,手动安装

install.packages(".../xxx.gz", repos = NULL)

...代表,你把下载的包放在哪个位置了

缺少哪个xxx包,就查找并下载

最后再devtools::install_github("mrcieu/gwasglue", force = TRUE)

后用 library("gwasglue") 验证一下,安装成功。文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-732396.html

到了这里,关于R语言 gwasglue 包安装的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处: 如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请点击违法举报进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

领支付宝红包 赞助服务器费用

相关文章

  • 【开发环境】Mac 安装 Visual Studio Code ① ( VSCode 简介 | 下载 VSCode | 安装 VSCode | 安装中文语言包 )

    Visual Studio Code 简称 VSCode , 是 微软 开发的一款 轻量级 / 跨平台 的代码编辑器 ; VSCode 支持 Windows、macOS 和 Linux 操作系统 ; VSCode 支持如下 编程语言 : JavaScript TypeScript Node.js C++ C# Java Python PHP Go VSCode 集成了调试器 , 可以调试 上述 多种语言 ; VSCode 内置了 Git 版本控制插件 , 可以

    2024年04月28日
    浏览(67)
  • Redis详解,包括安装命令,应用场景,优缺点,案列分析,各个开发语言如何应用

    Redis 是一个基于内存的开源数据库系统,被广泛应用于 Web 应用、消息队列、缓存、实时统计等领域。下面是 Redis 的详解,包括安装命令、应用场景和优缺点,以及案列分析和各个开发语言如何应用。此外,还提供了一些具体代码示例。 Redis 的安装命令因操作系统而异。以下

    2024年02月15日
    浏览(42)
  • 【开发环境】Mac 安装 Visual Studio Code ② ( 装 C/C++ 扩展 | 安装配置 Code Runner 扩展插件 | 运行 C 语言程序 )

    在 VSCode 中 , 点击 左侧 的 \\\" 扩展 \\\" 按键 , 在 扩展 面板中 , 默认显示之前已经安装过的 扩展 ; 在 扩展面板 中的 搜索栏 , 输入 \\\" C \\\" , 第一个就是 C/C++ 扩展 , 点击 \\\" 安装 \\\" 按钮 , 安装改 扩展插件 ; 安装完毕后 , 提示 如下内容 ; 在 扩展 面板中 , 搜索 \\\" runner \\\" , 搜索出的第一个

    2024年04月25日
    浏览(84)
  • 开发语言漫谈-C语言

           个人认为C语言是最伟大的开发语言(没有之一)。C语言开创了高级语言的新时代。比C更低级的是汇编语言,这个东西就是反人类的玩意。之后的语言或多或少都受C语言的影响。更神奇的是直到现在,C语言还有生命力。C语言的发明人丹尼斯·里奇是图灵奖得主,C语

    2024年04月13日
    浏览(74)
  • 主流开发语言和开发环境?

    主流开发语言 Java 简介 :Java 是一种广泛使用的面向对象的编程语言,由Sun Microsystems公司于1995年发布,后由Oracle公司接手。Java具有“一次编写,到处运行”的特性,它的跨平台能力得益于Java虚拟机(JVM)。Java被广泛应用于企业级应用开发、移动应用(特别是Android应用)、

    2024年02月20日
    浏览(41)
  • 主流开发语言和开发环境介绍

    Tips:TIOBE排行榜是根据互联网上有经验的程序员、课程和第三方厂商的数量,并使用搜索引擎(如Google、Bing、Yahoo!)以及Wikipedia、Amazon、YouTube和Baidu(百度)统计出排名数据,只是反映某个编程语言的热门程度,并不能说明一门编程语言好不好,或者一门语言所编写的代码数

    2024年02月21日
    浏览(42)
  • 鸿蒙的开发语言、工具以及开发环境。

    一、鸿蒙开发主要使用华为自主研发的鸿蒙操作系统(HarmonyOS)支持的语言进行应用开发。根据官方文档和资源,鸿蒙系统支持多种开发语言。 1. Java:作为鸿蒙系统原生支持的开发语言之一,Java在鸿蒙应用开发中占据重要地位,尤其是对于Android开发人员来说,可以较为容易

    2024年04月27日
    浏览(35)
  • 【HarmonyOS北向开发】-05 ArkTS开发语言-ArkTS开发实践

    飞书原文档:Docs 

    2024年02月11日
    浏览(54)
  • idea插件开发-自定义语言00-开发导航

     源码 Initial Setup(初始化设置) ​​Registering a File Type​​​ :注册文件类型要实现一个自定义的语言必须要实现的,​​示例代码​​ ​​Implementing Lexer实现​​ :实现编程语言的语法分析器,​​示例代码​​ ​​Implementing Parser and PSI​​​:实现一个词法分析器

    2024年02月12日
    浏览(34)
  • 【开发语言】C语言与Python的互操作详解

    博主未授权任何人或组织机构转载博主任何原创文章,感谢各位对原创的支持! 博主链接 本人就职于国际知名终端厂商,负责modem芯片研发。 在5G早期负责终端数据业务层、核心网相关的开发工作,目前牵头6G算力网络技术标准研究。 博客内容主要围绕:        5G/6G协议

    2024年02月10日
    浏览(66)

觉得文章有用就打赏一下文章作者

支付宝扫一扫打赏

博客赞助

微信扫一扫打赏

请作者喝杯咖啡吧~博客赞助

支付宝扫一扫领取红包,优惠每天领

二维码1

领取红包

二维码2

领红包