力扣_字符串10—重复的DNA序列

这篇具有很好参考价值的文章主要介绍了力扣_字符串10—重复的DNA序列。希望对大家有所帮助。如果存在错误或未考虑完全的地方,请大家不吝赐教,您也可以点击"举报违法"按钮提交疑问。

题目

DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 ‘A’, ‘C’, ‘G’ 和 ‘T’.。

例如,“ACGAATTCCG” 是一个 DNA序列 。
在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。

给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。

示例 1:

输入:s = “AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT”
输出:[“AAAAACCCCC”,“CCCCCAAAAA”]文章来源地址https://www.toymoban.com/news/detail-827755.html

方法

  • 哈希+滑动窗口
    • 由于 s 中只含有 4 种字符,我们可以将每个字符用 2 个比特表示,即:
      • A 表示为二进制 00
      • C 表示为二进制 01
      • G 表示为二进制 10
      • T 表示为二进制 11
    • 我们可以将 s 的每个长为 10 的子串用一个 int 整数表示(只用低 20 位),该 int 作为哈希表的key
    • 窗口每次向右滑动一个字符,左边的两个 bit 滑出,右边滑入两个新的 bit

代码

class Solution {
public:
    // vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s) {
    //     int n = s.size();
    //     map<string, int> maps;
    //     for(int i = 0; i <= n-10; i++){
    //         maps[s.substr(i, 10)]++;
    //     }
    //     vector<string> ret;
    //     for(auto it : maps){
    //         if(it.second > 1){
    //             ret.push_back(it.first);
    //         }
    //     }
    //     return ret;
    // }

    vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s){
        int n = s.size();
        map<char, int> maps = {{'A', 0}, {'T', 1}, {'C', 2}, {'G', 3}};
        map<int, int> cnt;
        int x = 0;
        for(int i = 0; i < 10-1; i++){
            x = (x<<2) | maps[s[i]];
        }
        vector<string> ret;
        for(int i = 0; i <= n-10; i++){
            x = ((x << 2) | maps[s[i + 10 - 1]]) & ((1 << (10 * 2)) - 1);
            if(cnt[x] < 2){
                cnt[x]++;
                if(cnt[x] == 2){
                    ret.push_back(s.substr(i, 10));
                }
            }
        }
        return ret;
    }
};

到了这里,关于力扣_字符串10—重复的DNA序列的文章就介绍完了。如果您还想了解更多内容,请在右上角搜索TOY模板网以前的文章或继续浏览下面的相关文章,希望大家以后多多支持TOY模板网!

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