前言
前面我学习了利用DTI构建白质纤维脑网络,并采用GRETNA计算了小世界网络属性。阅读文献发现可以利用灰质体积或皮层指标(皮层厚度、折叠指数、沟深)等构建结构协变网络再进行网络拓扑属性的计算。因此,我采用前面提取的灰质体积和皮质数据进行了结构协变网络分析,特此写下笔记以便后面的学习。
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一、数据准备
1.1提取ROI灰质体积
将前面分割得到的灰质文件(mwp1*)整理到一个文件中
可以采用dpabi和restplus两个工具包提取ROI灰质体积,二者操作类似,因此下面只记录其一。操作步骤如下:
(1) 安装dpabi,下载dpabi安装包,打开MATLAB设置dpabi
(2) MATLAB命令行输入dpabi,打开dpabi,选择Utilities,再选择ROI Signal Extractor
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